Eduardo Alonzo es Licenciado en Relaciones Internacionales por la Universidad de El Salvador, Maestrante en Integración Centroamericana y Desarrollo por la Universidad Rafael Landívar.
Cuenta con una especialización en Procesos de Integración Comparada por el Instituto Ítalo Latino Americano desarrollada en Italia, Bélgica y Luxemburgo, así como una especialización en Diplomacia Latinoamericana por la Academia Diplomática Andrés Bello de Chile.